保健食品由于各種功效成分或標志性成分在貯存過程中易受空氣、溫度、濕度、光線、微生物等因素的影響而發生各種復雜的物理、化學或生物化學方面的變化，進而影響保健食品的質量及使用安全，故選用適宜的保健品瓶及先進的包裝技術與保健食品質量的優劣緊密相關，保健品瓶的主要作用首先是保護保健食品質量，防止保健食品功效成分或標志性成分失效變質。
1.阻隔作用
保健品瓶應使容器內的藥物成分不能穿透、逸漏出去，而外界的空氣、光線、水分、熱、異物、微生物……不得進入容器內與藥品接觸。許多保健食品的穩定性和療效會隨進入或逸出它們的包裝容器的氣體、光、熱、水分……而發生改變。如片劑、沖劑等固體制劑因吸潮而發霉變質；口服液等液體型保健食品因受溫度、光、空氣、微生物的作用而發酵……。阻隔作用方面應突出考慮的有以下幾方面的問題：
(1)防穿透:揮發性功效成分或標志性成分能溶解于包裝材料的內側，借滲透壓的作用向另一側擴散移動。即揮發性成從可容器壁的分子間擴散出來。從包裝外面可以明顯聞出藥味來。尤其是紙裝、聚乙烯單層塑料薄膜之類的包裝，具明顯的透氣、透光、透水分的性能，不但藥物芳香成分從壁逸出，而氣體(如O2、CO2)、水蒸汽等能直接透過保健品瓶進入容器，影響保健食品的穩定性。諸如蕓香草油之類，它對一般有機物的保健品瓶有強的溶蝕作用，穿透性更明顯，盛于明膠作的硬膠囊殼內不到兩周就穿透出來。為了防止穿透現象的產生，在選擇包裝材料時應選擇透性小的材料作藥品的單個包裝。這方面各種復合膜容器、玻璃容器、金屬容器、陶瓷容器效果較好。
(2)遮光:維生素E等功效成分遇光線照射而氧化變質，包衣丸、片(尤檸檬黃著色衣)因光照而顏色變暗。對這類保健食品的包裝，除密封外還需遮光。保健食品包裝遮光常采用三種辦法：①傳統多用棕色保健品瓶或瓶內各物用紙包裹；②新材料系用鋁塑合膜，鋁、紙塑復合膜；③在保健品瓶內添加遮光劑，如二氧化鈦之類。
(3)防泄漏:保健食品的揮發性或不揮發性組分、固體或液體藥物經過不連續或包裝材料，如材料上的針孔、裂縫或瓶蓋與保健品瓶之間的間隙而逸出或漏出。這種情況多半發生在保健品瓶的結構設計和包裝工藝不當的情況下，當然有時也因選料不當而造成。
2.緩沖作用
保健食品在運輸、貯存過程中，要受到各種外力的振動、沖擊和擠壓，易造成破損。如玻瓶包裝易碎裂；薄膜、紙袋之類包裝又易壓變形。為此，保健品瓶應具有緩沖作用，以防止震動、沖擊和擠壓。
(1)襯墊的作用:單個包裝的內外都要使用襯墊，它是密封裝置的重要組成部分，是防止震動的有利措施。丸、片等固體藥物，常于保健品瓶內多余空間部位填裝消毒的棉花、紙條或塑料蓋上帶的塑料彈簧圈，使瓶子寒滿后藥物無移動的空問。單個包裝的外面(即保健品瓶之問)多使用瓦楞紙或硬質塑料作成瓦楞形槽板，將每個容器固定且分隔起來。目前還有用新材料：發泡聚乙烯、泡沫聚丙烯及聚乙烯和聚苯乙烯共聚樹脂泡沫等緩沖材料作成緩沖包裝的，效果良好。
(2)外包裝又稱分發包裝:系以具一定機械強度的材料制成的大容器，具有防震、耐壓和封閉的作用。
國際運輸包裝：除一般要求外，對完整、滿裝的運輸包裝，還要進行如下項目的檢測：
①標示包裝的部位及牢固性；②對溫度、濕度的調節性能；③堆碼實驗；④通過跌落進行垂直碰撞實驗；⑤水平碰撞實驗、斜面試驗、擺動試驗等。
3、保護保健食品的功效成分或標志性成分
凡保健食品不管其劑型物態如何，一般均有遇空氣易氧化、染菌，遇光易分解變色，遇濕易潮解變質，遇熱易揮發、軟化、熔解、崩裂，激烈的震動使變形、碎裂等等問題發生。保健食品物理性質或化性質的改變，均會使功效成分或標志性成分失效，不但不能起到保健作用病，有的反而會致病。況且多數保健食品有二年到三年左右的工廠保質期，在這么長的時間內，通過保健品瓶壁的微孔(如聚乙烯、聚丙烯等塑料)或保健品瓶與蓋之間的間隙(密封不嚴實或變形)進入氣體、水分都會導致保健食品的變質。在保質期內，保健食品保存中存在的問題由生產廠家承擔責任。所以，保護功能對廠家、消費者來說皆至關重要。保健食品包裝不論在造形、結構和裝璜的設計上，還是保健品瓶材料的選擇上，都應把保護功能作為首要因素來考慮，而保護功能的各個方面中(如防震、防寒、防熱、防輻射、防蟲蛀等等)，又以密封，即徹底與外界隔絕最為重要。
4.其它
保健品瓶內的表面與保健食品長期接觸中不能發生任何作用，而且其釋出物與保健食品之間、保健食品釋出的功效成分或標志性成分與保健品瓶之間也不能產生任何作用。
另外，保健品瓶如塑料的降解產物，涂料、塑料、橡膠等材料中所含的各種添加劑(如
增塑劑、潤滑劑、脫模劑、穩定劑、抗氧劑、抗靜電劑、色素等)，在貯存過程中若逐漸釋出會污染保健食品，必須慎重考慮
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